中国远征军在遭遇日军据守的城镇的时候，往往直接呼叫轰炸支援，使用凝固汽油燃烧弹和新式的预制破片集束炸弹，或者白磷燃烧弹实施攻击，直接将城镇夷为平地，对于中国远征军来说，在装甲部队的掩护下对凭借简陋工事抵抗的日军实施进攻，似乎轻而易举一般，但是实际上一旦双方爆发惨烈无比的巷战，中国远征军同样亦伤亡巨大。
因为无论男女老幼都有背着手榴弹高呼天皇万岁冲向中国远征军官兵的情况出现，这令得中国远征军全体官兵很有措手不及的感觉，精神时刻都处于紧张之中，相比冲绳之战压力更大，中国官兵向一切可疑的目标实施射击，误杀自然不在少数，但是战争已经进入了白热化阶段，日军以陆海军第三招募区的留守部队组建起来的第八十二师团、第八十七师团、第九十二师团、第九十五师团、第九十七师团，战车第三师团、战车第四师团作为主力，意图向东京实施反扑，激烈的战斗让日军损失巨大，1944年8月29日凌晨，日军动员了十一个师团在内的部，包括前段时间主动出击的第八十二师团、第八十七师团、第九十二师团、第九十五师团、第九十七师团，战车第三师团、战车第四师团等部队。
第八十二师团、第八十七师团、第九十二师团、第九十五师团、第九十七师团是原来隶属于关东军的部队，主力在远东战役期间覆灭，此番以残部在本土重新组建起来，战斗力就打了折扣，加之部队皆是三联队不满编的情况，又过早的投入了反击，在中国远征军的地空火力之下损失惨重。
但是，此番军部下达了限期务必复克东京的命令，明知这是难以完成的任务，日军参战的部队以国民挺身队和奋勇队为主体于29日凌晨从南北两线开始对中国远征军实施南北对攻，为此日军集中了最后的三百余架作战飞机投入的作战，为的就是进行最后一搏，在美军连续六个月的无差别战略轰炸之下，日本的工业体系已经被彻底摧毁，所有武器弹药供应也陷入了停止，很多反击的国民挺身队员只有一支竹枪，更多的人赤手空拳的跟在主攻部队身后，捡拾阵亡官兵的武器继续作战。
菊字第五号作战在战后被称为日本人的最后疯狂，以至于之后的菊字第六号作战彻底的胎死腹中，日军累计在连续五日的攻击中，投入了大约五十九万部队与国民挺身对于奋勇队，其死亡率高达百分之九十，在日军部队出击之前，各师团的师团长与军司令官、参谋长纷纷剖腹自尽，以激励部下誓死决战，于是日军与挺身队、奋勇队在内的近六十万作战部队，开始部分昼夜，冒着中国远征军猛烈的地空火力，如同浪潮一般在长达一百五十公里的战线上发动了一波又一波的猛攻。
可以说，横尸遍野、堆尸如山都不如以形容日军此战的惨烈，中国远征军亦付出了超过二万人的伤亡，很多阵地被日军突破，防御阵地的官兵在最后时刻呼叫向我开炮！惨烈的鏖战进行到第五天，中国远征军又有二个装甲师在内的七个整编师登陆，随即对日军实施反突击，参加进攻的日军部队被中国远征军反击部队追击近百公里，沿途的路边、山岗之下、水沟、田地之间、城镇的废墟间，到处都是日军与奋勇队、挺身队的遗尸，大量绝望的日军伤员用仅有的手榴弹自尽，用手榴弹自尽已经是十分奢侈的行径了，大批的日军伤员被集中到洼地遗弃，日军甚至连处理自己伤员的时间都没有了。
菊字五号作战计划，让日本人的菊花被彻底炸开了，实际上日军投入的挺身队和奋勇队以及正规部队总数超过八十万人，但是由于盟军猛烈的轰炸损失惨重，最终只有八成的部队抵达了作战地域，在位于北部川崎山脉余脉的防空洞内，御前会议从9月6日一直开到8日凌晨，可以说菊字五号作战计划的失败让四十四岁的裕仁天皇已经感到了精疲力竭，虽然与会的将领们都在叫喊着一亿玉碎，但是包括裕仁天皇也从同美国接触的外交代表团传回的消息，由于中国方面坚持严惩一切战犯，包括废除日本的天皇制在的条件，所谓的谈判一直在原地踏步。
五天的交战让中国远征军集中了三百辆推土机，足足二十天还没能掩埋全部的尸体，这让在准备举国玉碎的日本人头上如同滴水成冰的冬天浇了一盆冰水，即使连妇女儿童也扛着竹枪上阵，即使像他们疯狂宣称的一样死上一亿人，本土决战看来也绝不会有任何一丝胜利的希望，中国远征军似乎有打不完的炮弹和投不完的航空炸弹。
很多绝望之际，面对美军大规模的战略轰炸异常绝望的人都聚到一起，用发给他们用于袭击中国远征军部队的炸药和手榴弹，进行集体自杀，一些日本女人甚至直接自己的孩子按在水里淹死，失败的气氛弥漫在部队和国民之中，战斗下去无非是死路一条，看不到一丝一毫可以活下去的希望，每天都有大批的人在自杀。
甚至在裕仁天皇的地下工事堡垒中，在开会的三天时间里，有六名大本营的战术参谋举枪自尽或者剖腹自尽的，这让裕仁天皇彻底的心灰意冷，裕仁天皇能看得出来，中国远征军之所以要求严惩自己和废除天皇制度，实际上是不希望日本投降，如果日本宣布无条件投降，他们就失去了大规模屠杀的借口和理由，惨烈的交战和美国空军持续不断的战略轰炸已经让日本损失了超过三成的人口。
对于日本人来说，这个损失是极度巨大的，尤其是菊字五号作战计划的失败，导致国民与军队的士气彻底总崩溃。