柯南很清楚，工藤优作再次化身冲矢昴，意图达到被冲矢美玖“说服”，成为十二个死亡术士之一。而事实上，却是为了瓦解那个名为“十二个死亡术士”的罪恶的同盟。然而，里面究竟涵盖着怎样的真相，就宛如黑衣组织一样，似乎是没有任何头绪。
而柯南唯一知道的，也只有与他们关联很深的人之中，有皮斯科和新加坡司令而已。但如今，皮斯科在那场大火中丧生，在他的尸体中，发现了几枚子弹，据悉和灰原那次被攻击使用的手枪是同一个型号。所以，柯南则断定为，是琴酒为了达到某种目的而杀了皮斯科，之后又为了防止东窗事发而杀害了皮斯科的养子爱尔兰。
现如今，新加坡司令已经出动很久了，没人知道他的行动是什么，但单纯阻止了上次的事件，在黑衣组织内部，对新加坡司令的做法产生疑问的人就有不少，比方说琴酒，还有就是组织的二把手朗姆。要知道，朗姆是专门为了调查毛利小五郎，准确的说，是调查工藤新一才会出现在米花町的，但新加坡司令的到来，直接打了他一个措手不及，并且阻止了他的一次进攻计划，这怎么可能让他不恼火。
不过，基尔却很快就给他们带来了一个消息：“新加坡司令在调查琴酒。”
琴酒有些意外，不过随即冷哼了一声：“原来如此，只不过，我想那位先生一定会有指示才对。”
基尔微微一笑：“没错，在新加坡司令调查清楚之前，Boss希望你可以安心呆在组织里。至于其他的事情，Boss会派贝尔摩德和波本去工作，毕竟，新加坡司令可是狠狠地参了你一本。”
“哦？他说什么了？”
“当然是和皮斯科有关，虽然下令杀掉皮斯科的人确实是Boss，不过，在你杀害爱尔兰的时候，新加坡司令就已经在得到Boss的命令下对这件案子进行调查，琴酒，我想，这应该是你犯下的最愚蠢的错误了。”
“哼，新加坡司令吗？我倒是想尝尝，他到底是一种什么味道的酒。”
新加坡司令在看到那一串数字的时候，嘴角浮现出淡淡地笑意，这次就算是不能拿下琴酒，也势必会让他远离核心区。对于那位先生来说，最信得过的人还是贝尔摩德就是了，而和波本联手演戏，或许就是Boss最意想不到的杀招。
一天前，冲矢昴已经安排冲矢美玖离开日本，这一点也是有原因的，因为冲矢美玖的身份对于黑衣组织来说，很容易查到一些东西，甚至是暴露赤井秀一的真实身份。虽然，他已经准备好以赤井秀一的身份来迎接这个世界了，但是毕竟还不到最终摊牌的时候。
那天晚上，柯南和他们交了一个底：